「スーパーロボット大戦OG外伝」に収録されているストーリーは「EPISODE2.5 UNFIED WISDOM」になります。「スーパーロボット大戦 ORIGINAL GENERATION」「スーパーロボット大戦 ORIGINAL GENERATION2」に続くストーリーです。
EPISODE2.5 UNFIED WISDOM」はPS2版「スーパーロボット大戦OG オリジナルジェネレーションズ」にも前半部分のみ収録されていました。その話の続きになります。
ただ、「スーパーロボット大戦OG オリジナルジェネレーションズ」で収録されていた前半部分にもアレンジされています。